MOTS-CLEFS : Microarrays, statistiques, R, données ‘omiques.

PRÉREQUIS : être sensibilisé à R - possibilité de suivre le module Initiation à R.

OBJECTIFS :

Le module Microarrays : Analyse statistiqueq vise à vous initier aux traitements statistiques les plus courants de données d’expression associées aux microarrays.

PUBLIC CIBLÉ :

Ingénieurs, techniciens, chercheurs, cliniciens, post-doctorants, doctorants, stagiaires (master, …) des secteurs académique ou privé.

DATE ET LIEU :

Pas de session 2024.

Agrocampus Ouest, 65 rue de saint Brieuc, Rennes.

PÉDAGOGIE :

La formation se veut équilibrée entre théorie et pratique, la pratique se faisant via l’analyse d’un jeu de données microarrays réel à 2 facteurs et 2 modalités par facteur.

FORMATEUR : David Causeur et Sandrine Lagarrigue.

TARIFS ET INSCRIPTION :

Cliquez ici pour connaître les tarifs et vous inscrire.

Tarifs préférentiels par rapport aux tarifs affichés selon convention (certaines Ecoles doctorales et centres INRA).

PROGRAMME :

1. Exploration et pré-traitement des données Microarray :

• Origine des données et caractéristiques,
• Importation du jeu de données de microarray,
• Recherches d’individus ou sondes « aberrants »,
• Sélection de gènes dits exprimés.

2. Quels sont les gènes différentiellement exprimés entre conditions analysées ?

• Package Limma,
• Analyse de variance,
• Correction pour les tests multiples.

3. Y-a-t-il des groupes de gènes ou d’individus présentant des profils similaires ?

• Classification ascendante hiérarchique.